In totaal heeft Vlaanderen 166 187 ha (12,3%) Natura 2000-gebieden, er is namelijk deels overlapping tussen de SBZ-V en SBZ-H. In het Natura 2000-netwerk werden voor Vlaanderen geen mariene gebieden inbegrepen omdat deze onder de Belgische federale overheid vallen.
7,8% habitatrichtlijn kan weinig lijken in vergelijking met de 18% oppervlakte in Europa, maar in vergelijking met de ons omringende dichtbevolkte economische topregio’s is dit erg veel.
Elke lidstaat van de EU werd verplicht om gebieden, de SBZ’s, af te bakenen waarin men deze soorten en habitattypes moet beschermen. In deze gebieden zullen de lidstaten dan zelf maatregelen moeten nemen voor het bekomen van een gunstige staat van instandhouding van de betreffende soorten en habitats. De staat van instandhouding (SVI) wordt geëvalueerd op basis van 4 Europees vastgestelde criteria, zijnde: populatie, areaal of verspreidingsgebied, habitat (kwaliteit en oppervlakte) en toekomstverwachtingen aan de hand van de trend.